Ninjini was de beroemdste magische ninja uit vroegere tijden, lang voordat de Arkeyanen de macht grepen. Maar een duistere tovenares die jaloers was op de krijgskunsten van Ninjini sloot haar op in een betoverde fles waar ze de rest van de eeuwigheid moest uitzitten. De tijd verstreek, maar Ninjini bleef vastberaden om te ontsnappen. Ze kreeg zelfs de dubbelezwaard-techniek onder de knie in de eenzaamheid van haar fles. Gedurende vele jaren groeide haar kracht tot ze eindelijk op pure wilskracht uitbrak! Vanaf dat moment wilde Ninjini, een van de eerste Skylanders, zo veel mogelijk anderen in nood helpen. Ze draagt de betoverde fles altijd bij zich als aandenken aan haar veerkracht.