Relp! Scooby-Doo en de bende zijn in cyberspace gestraald en ze zijn niet de enigen. Het sluwe Phantom Virus heeft zijn oude trucs onder de knie en heeft een verscheidenheid aan lafhartige schurken tot zijn beschikking. Help de Scooby-bende om naar aanwijzingen te zoeken, griezelige schurken af te weren en misschien zelfs het Phantom Virus te ontmaskeren!