In Dissidia: Final Fantasy verschijnen personages uit verschillende delen van de serie, zoals: Tidus, Zidane en Squall. Zij vechten tegen elkaar.

In het verhaal staan de godin Cosmos en de gad Chaos centraal. Zij voeren een strijd tegen elkaar. Hoewel ze allebei bijna even sterk zijn is het Chaos die de balans verstoord met een zeer krachtig wapen. Weet jij de balans te herstellen?