Zoo Hospital laat je meer dan 48 verschillende soorten vogels, zoogdieren en reptielen onderzoeken en verzorgen in een wereldberoemde dierentuin. In de game werk je met wilde diersoorten, waaronder dolfijnen, gorilla's, papegaaien en kamelen. Deze moet je identificeren en hun kwaaltjes verzorgen. Door het gebruik van de Wii-afstandsbediening kun je medische minigames spelen.

Zo moet je operaties uitvoeren om parasieten te verwijderen, tanden uittrekken, röntgenfoto's maken en nog veel meer. Stap voor stap wordt er uitgelegd hoe je verschillende ziektes en kwaaltjes kunt behandelen en de dieren tijdens hun ziektebed kunt begeleiden. Een coöperatieve modus voor twee spelers laat je samen met een vriend een dier verzorgen.